感兴趣的分子可以被排泄，也可以在细胞内积累。发生这种情况时，必须首先破坏细胞，防止降解，并从目标分子中分离杂质。

离心 和 微滤 是将分子与细胞分离的最佳方法，只能收集上清液进行进一步纯化。

实时测量  进出过滤器的压力、流量、 颗粒 积累、 粒度分布、 pH 值或细胞的浊度，可以提供反馈控制， 以最大限度地减少过程中断。

病毒被灭活并变得非致病性。 在线 光谱、浊度、pH 值监测和控制保证了整个过程的一致性。

通过色谱分离和浓缩目标产物。

使用含有蛋白 A、蛋白 G 的树脂或其他选择性工程方法通过亲和色谱捕获抗体，而寡核苷酸和非蛋白质分子通常通过 离子交换 色谱捕获，多 糖和复合聚糖通常通过疏水相互作用或 IMAC 色谱捕获。

常见的测量包括 色谱柱前的压力、流量、pH、 傅里叶变换红外 （FTIR） 光谱、 UV-Vis 和 电导率 ，以监测可变的进料输入并提供有关色谱柱质量和性能的信息。 

在纯化步骤中，残留杂质（如 蛋白质、 核酸、内毒素 等）通过 一系列单元操作（澄清、萃取、色谱、切向流过滤）去除，同时尽可能保留产品，并通过超滤/渗滤 （UF/DF） 使用切向流过滤 （TFF） 进一步浓缩。

目标是 在不损失产量的情况下提高纯度。在缓冲液制备和纯化过程中监测流量、压力、电导率、pH 值、浊度和产量重量，确保整个过程的可靠性。

病毒被灭活并变得无致病性，通过改变溶液环境（降低 pH 值或添加溶剂/去污剂） 来确保生物治疗药物的安全性 。在线 光谱、浊度、pH 和 ORP 监测和控制保证了整个过程的一致性。

通过抛光，可以达到最终的纯度。

科学家使用 体积排阻色谱 和 切向流过滤 去除痕量杂质（病毒颗粒、细菌病原体和内毒素），并将纯化缓冲液与配方 1 交换。

虽然 FTIR 光谱法可以帮助在 精纯色谱过程中定量和确定馏分成分，但在整个精纯装置操作中 监测压力、流量、电导率、pH 值和浊度 ，包括缓冲液制备、 产品安全和质量保证。