La séparation de phase dans la cristallisation est un processus au cours duquel la sursaturation sépare le composé initialement dissous de la solution en produisant une phase liquide secondaire (émulsion) (image 1a) au lieu d'une phase solide et cristalline (suspension) (image 1c). La séparation de phase survient principalement lorsque l'intégration des molécules de soluté dans le réseau cristallin est cinétiquement entravée, retardée ou que le système connaît une sursaturation très élevée.
Les molécules de soluté présentes dans les gouttelettes par séparation de phase riches en produit peuvent s'agencer de manière aléatoire et présenter une mobilité bien plus élevée que dans un réseau cristallin rigide. Souvent, les gouttelettes par séparation de phase peuvent constituer un bon solvant pour les impuretés indésirables. En règle générale, les gouttelettes par séparation de phase sont instables et peuvent se transformer avec le temps en matériau amorphe (image 1b) ou se solidifier spontanément en un solide cristallin.
Souvent, la séparation de phase n'est pas facile à détecter et peut passer inaperçue, ce qui explique de nombreuses difficultés de processus lors de la mise au point et de la fabrication des cristallisations.