- 成核: 達到一致的初級成核，並避免次級成核事件。
- 生長: 提高成核上的生長率，以增加晶體大小。
- 油析: 決定相圖並避免發生油析。
- 結塊: 透過溶劑選擇和參數控制來避免結塊。
- 破損: 避免不當破損及添加，並控制所需之濕磨。
- 種晶: 達到最佳的種晶協議，以提供所需的微粒特性。
- 多形性變化: 操縱相圖以產生所需的形式。
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往往，這些機制會同時發生，使人很難達成有效的結晶設計。在不瞭解機制的情況下，科學家靠著不斷試誤調整流程參數並達到最佳的良率、純度及晶體大小。藉由瞭解結晶期間發生哪些機制，科學家能部署策略，提供具有所需特性的晶體產物。
