Pipety pro výzkum stresové reakce v buňkách

Všechny organismy jsou po celou dobu svého životního cyklu vystaveny krátkodobému i dlouhodobému stresu. V důsledku toho mohou genomy, epigenomy a proteomy buněk způsobit poškození, které je třeba opravit, aby byla zachována normální funkce. Jak však organismy stárnou, jejich schopnost reagovat jak na běžné opotřebení, tak na mimořádné stresy, jako jsou vysoké teploty nebo toxiny, klesá.

Výzkum v laboratoři Dillin na Kalifornské univerzitě v Berkeley se zaměřuje na to, jak organismy na buněčné úrovni reagují na účinky stresu, které současně zmírňují, a jak tyto reakce podpořit u stárnoucích organismů. Jejich práce se zabývá zejména otázkou, jak snížit výskyt onemocnění souvisejících s věkem, která přímo souvisejí se zhoršenou reakcí na stres, mimo jiné např. cukrovky a rakoviny, a podpořit tak zdravější stárnutí.

Dr. Ryo Higuchi-Sanabria v laboratoři Dillin na Kalifornské univerzitě v Berkeley

Hlavní složka práce laboratoře Dillin je zaměřena na odhalování genetických cest zapojených do stresové reakce. Ryo Higuchi-Sanabria, postgraduální student v laboratoři, zkoumá tuto oblast studia v modelovém systému C. elegans prostřednictvím screeningu celého genomu a validace cíle. Klíčový přístup představují obrazovky RNA interference (RNAi), na kterých jsou nematody C. elegans vystaveny knihovně RNAi uložené ve formátu s 96 nebo 384 jamkami.

Každá jamka knihovny obsahuje kazetu, která může „rozložit“ jeden z přibližně 20 000 genů C. elegans. Nematody vystavené působení této kazety v důsledku toho efektivně postrádají funkci RNA nebo proteinu, který je v ní zakódovaný. Nematody jsou poté podrobeny určitým typům působení stresu. Pokud se u nematod, kterým chybí funkce konkrétního genového produktu, vlivem působení stresu zvýšila nebo snížila míra přežití, může to znamenat, že při stresové reakci hrají roli genetické cesty, ve kterých se tyto produkty nacházejí.

Jakmile jsou prostřednictvím screeningu identifikovány potenciální geny související se stresem, Dr. Higuchi-Sanabria a jeho kolegové pomocí kvantitativní polymerázové řetězové reakce (PCR) ověřují, jestli byla exprese genů ve sledovaných nematodách skutečně „rozložena“. Vzhledem k množství genů C. elegans, které se pohybuje v řádů tisíců, vyžaduje příprava knihoven, nastavení obrazovek a validace kandidátských genů velkou míru pipetování a laboratoř Dillin v tomto ohledu do značné míry spoléhá na vícekanálové pipety Rainin společnosti METTLER TOLEDO.

V roce 2018 zahájila společnost METTLER TOLEDO svou první iniciativu Supporting Science a nabídla vítězovi pipetu dle vlastního výběru. Dr. Higuchi-Sanabria již dříve hovořil s manažerem laboratoře Dillin Joem Larrym o nákupu dalších vícekanálových pipet Rainin. Zvláště se zajímal o vícekanálovou pipetu s nastavitelnou šířkou, kterou lze použít k přenosu vzorků mezi zkumavkami mikroodstředivky ve stojanu a destičkách s 96 nebo 384 jamkami, nebo o 2–20μl vícekanálovou pipetu, která dokáže přesně přenášet mezní vzorky (3–12 μl) mezi PCR proužky a destičkami s jamkami.

S příslibem toho, že bude možné bezplatně získat jednu z nich, pan Joe vyzval Dr. Higuchi-Sanabriu k účasti v soutěži Supporting Science, kterou vyhrál prostřednictvím seminární práce porovnávající jeho předchozí působení jako baristy se svojí současnou experimentální pozicí v laboratoři Dillin.

Společnost METTLER TOLEDO s potěšením oznamuje, že Dr. Higuchi-Sanabria a laboratoř Dillin se rozhodli pro 2–20μl elektronickou vícekanálovou pipetu, která z hlediska přesnosti zlepší průchodnost screeningu a validace bez rizika poranění z opakovaného přetěžování.

Příbuzné produkty a řešení