La synthèse parallèle permet de réaliser des gains de temps considérables et une différenciation des composés en exécutant plusieurs expériences simultanément.
La synthèse parallèle est employée pour accélérer la découverte de nouveaux composés et réaliser un criblage en vue d'obtenir des conditions de procédé optimales. Dans le secteur pharmaceutique, la synthèse parallèle permet la découverte et le développement de médicaments-candidats potentiels. Elle autorise par exemple la synthèse de vastes bibliothèques avec diverses structures chimiques qui peuvent être analysées pour déterminer une activité biologique potentielle
Les applications de la synthèse parallèle comprennent la génération et l'optimisation de molécules à potentiel, ainsi que le criblage pour obtenir des conditions de réactions optimales. Ainsi, lors de l'extrapolation et du développement des procédés, les méthodes de synthèse parallèles accélèrent l'optimisation des procédés en fournissant une meilleure compréhension de l'effet des paramètres variables de la réaction, notamment les systèmes de solvants, les températures et les concentrations optimales, les réactifs adaptés, les délais de réaction et le choix des catalyseurs.