Sự tăng trưởng của vi sinh vật và các chất không ổn định thì không tốt cho bia. Tuy nhiên việc ngăn chặn thì không hề dễ dàng. Thiết kế chuẩn vệ sinh, chịu được CIP, các phép đo Oxy, CO2 và độ đục đóng vai trò quan trọng trong việc ngăn ngừa nhiễm bẩn cho bia